Die kurze Antwort auf diese Frage lautet nein; Cookies sind nicht schädlich. Wie so oft, gibt es aber auch hier ein "aber".
Grundsätzlich sind Cookies etwas sehr nützliches. Sie können zum Beispiel dazu dienen besondere Vorlieben von Ihnen zu speichern. Zum Beispiel eine bestimmte Sprache, Farbe, Schriftgröße, aber auch den Inhalt eines Warenkorbs während Sie in einem Onlineshop stöbern.

Was sind denn eigentlich Cookies?
Vereinfacht gesagt, handelt es sich bei Cookies um kleine Textdateien die beim Besuch einer Internetseite auf Ihrem Computer abgelegt werden. Beim nächsten Besuch oder auch auf der nächsten Seite wird der Cookie von der Internetseite wieder ausgelesen und ausgewertet.

Ein praktisches Beispiel:
Frau Marga Mustermann stöbert in einem Onlineshop und hat schon einige schöne Stücke gefunden und in Ihren Warenkorb gelegt. Jeder Artikel der von ihr in den Warenkorb gelegt wird, schickt auch einen Cookie an den Computer von Frau Mustermann und wird dort gespeichert.
Überraschend ruft eine Freundin an und lädt Sie zum Essen ein. Erst einige Tage später findet Frau Mustermann wieder ein wenig Ruhe und kehrt zurück zu Ihrer Einkaufstour im Internet.

Beim erneuten Besuch ihres Onlineshops werden die auf ihrem Computer gespeicherten Cookies von dem Onlineshop gefunden und ausgewertet.
Das Ergebnis: Frau Mustermann findet alle Artikel die sie vor einigen Tagen ausgesucht hatte wieder in Ihrem Warenkorb vor.

Die negative Seite:
Im vorigen Beispiel "merkte" sich die Internetseite des Onlineshops, welche Artikel Frau Mustermann in den Warenkorb gelegt hat.
Selbst wenn Frau Mustermann keinen von diesen Artikeln gekauft hat, so kann sie doch (z.B. anhand einer eindeutigen Nummer) jederzeit wiedererkannt werden. Praktischer weise kann der Shopbetreiber dann sehr zielgerichtete Werbung anzeigen lassen.

Zusammenfassung:
Cookies werden heutzutage auf einem Großteil von Internetseiten eingesetzt und zwar überwiegend zu positiven Zwecken. Die angesprochene Erstellung eines Benutzerprofils, so nennt man das Zusammentragen von Daten über einen Benutzer, ist mit etlichen anderen Mitteln ebenfalls möglich. Im übrigen geschieht sie nicht nur innerhalb des Internets - oder wie viel Werbung haben Sie in Ihrem Briefkasten?
Empfehlenswert ist aus heutiger Sicht, dass Einschränken von Cookies, welches wir in einem weiteren Artikel beschreiben werden.